W roku 2021 pasożytniczy wirus znany jako "Gastrea" zaraża ludzi i zamienia ich w potwory. To, co pozostało z ludzkości, żyje teraz w murach Monolitu, ścianach wykonanych z varanium, jedynego materiału, który może zranić Gastreę. Aby przeciwdziałać zagrożeniu, jakie stwarzają Gastrea, "Przeklęte Dzieci" – dzieci płci żeńskiej, których ciała zawierają śladowe ilości wirusa, dające im nadludzkie zdolności – oficjalnie nazywane Inicjatorami przez Służbę Bezpieczeństwa Cywilnego Tendo, otrzymują partnerów zwanych Promotorami, ludźmi, którzy pracują, aby prowadzić i chronić młodych Inicjatorów. Te dwuosobowe zespoły są wysyłane na misje, aby walczyć z potworami stworzonymi przez wirusa Gastrea i trzymać je na dystans. "Black Bullet" obraca się wokół zespołu Enju Aihary, Inicjatora, i Satomi Rentaro, Promotora, którzy wyruszają na misje, aby walczyć z rosnącym zagrożeniem ze strony Gastrei w ich rodzinnym mieście Tokio.

Wszystkie Odcinki