Minęły dwa lata od nalotu CCG na Anteiku. Chociaż atmosfera w Tokio zmieniła się drastycznie ze względu na zwiększony wpływ CCG, ghule nadal stanowią problem, ponieważ zaczęły ostrożnie podchodzić, zwłaszcza do organizacji terrorystycznej Aogiri Tree, która przyznaje, że CCG to rosnące zagrożenie dla ich istnienia. Stworzenie specjalnego zespołu, zwanego Quinx Squad, może zapewnić CCG impuls potrzebny do eksterminacji niechcianych mieszkańców Tokio....